Keroro軍曹超劇場版5週年紀念作品！軍曹超劇場版系列中規模最大的冒險，在神秘之島「復活島」上，展開了一段冬樹與Keroro軍曹兩人，動人友情的終極冒險故事。有一天，冬樹從愛莉莎那得到了一個和軍曹長得一模一樣的奇妙石像，而且這個石像據說是從以摩埃石像聞名的復活島上取得的，為了解開謎團，軍曹和冬樹兩人便瞞著大家偷偷的展開了一段復活島的冒險之旅。當他們即將抵達復活島時，卻被突然出現的不明生物攻擊而失散了。

冬樹在尋找軍曹的過程中，碰到了一群不可思議的精靈瑪那，以及神秘的雙胞胎伊歐和拉那，也因此得知了島上的秘密與藍星即將面臨的危機。另一方面，遠在日本的Keroro小隊也在同一時間偵測到了巨大的能量反應，地點正是在復活島。Keroro小隊為了營救身處危險的軍曹與冬樹便立即整隊朝復活島出發。為了阻止可怕惡靈「惡客惡客」的侵略藍星計畫，軍曹即將遭遇史上最大的生死難關，而傳說中的究極守護神到底是誰呢？

在經歷了前四作陸、海、空、龍的主題後，已經跑遍全球的KERORO軍曹這次將目標鎖定在智利境內的神祕小島「復活島」。Keroro軍曹電影製作小組特地前進了這個特別的小島，這個佈滿火山岩的小島上雖然沒有樹木，卻豎立了兩百多尊的神祕巨石像，這些巨型石像稱作摩埃（Moai），是由巨大的火山岩石所製成，在火山口周圍可見到有多個正在雕塑中或已造好，有完整的人像，有些只有半身，有些只是露出半個面。大多數石像已經倒下，估計全島火山範圍內就有600個，現在可見到仍然屹立的約有70個，十分壯觀。

每座石像大約高約二十三至六十英呎，重約五十公噸，是由大塊火山岩堆整塊雕刻而成的，不過最神奇的是這些石像所在的位置並沒有製成石像所需的石質。曾經有考古學家推斷，最少每天要動用30個勞工，工作八小時，約用一年時間才能雕造出一座石像，但這還不包括要從岩場搬運巨石到一百呎外的地方、還要使每塊巨石站立所花費的時間人力。這即使是現今的科技也很難做到，而這些石像被豎立在此的目的目前也無從得知，一切的謎團都加重了這個小島的神秘色彩，而此次KERORO軍曹超劇場版5的故事就要在這裡充滿謎團地展開囉。